Evolutionäre Ursprünge des SARS-CoV-2-Sarbecovirus

Es gibt immer noch offene evolutionäre Fragen zum Auftreten von SARS-CoV-2. Dies schließt auch die Rolle der Reservoirspezies, der Rekombination und der Zeitspanne der Divergenz von tierischen Viren ein.

Prof. Maciej Boni von der Pennsylvania State University (USA) und seine internationalen Kollegen stellten in ihrer Studie fest, dass die Sarbecoviren, die SARS-CoV und SARS-CoV-2 enthaltene virale Untergattung, häufig rekombiniert werden und in China auf regionaler Ebene eine räumlich strukturierte genetische Vielfalt aufweisen. Die Divergenzdaten zwischen SARS-CoV-2 und dem Fledermaus-Sarbecovirus-Reservoir weisen außerdem darauf hin, dass die Linie, aus der SARS-CoV-2 stammt, seit Jahrzehnten unbemerkt in Fledermäusen zirkuliert.

Um phylogenetische Datierungsmethoden anzuwenden, wurden rekombinante Regionen eines 68-Genom-Sarbecovirus-Alignments mit 3 unabhängigen Methoden entfernt. Es konnte demonstriert werden, dass die Schätzungen der Evolutionsrate nach der Bayesschen Methode und des Divergenzdatums für diese 3 Ansätze und für 2 verschiedene frühere Spezifikationen der Evolutionsraten basierend auf HCoV-OC43 und MERS-CoV konsistent sind. Es zeigte sich auch, dass SARS-CoV-2 selbst keine Rekombinante von bisher nachgewiesenen Sarbecoviren ist.

SARS-CoV-2 besitzt ein Rezeptorbindungsmotiv, das für die Spezifität für den menschlichen Angiotensin-Converting-Enzyme-2-Rezeptor wichtig ist. Es scheint aber ein Ahnenmerkmal zu sein, das SARS-CoV-2 mit Fledermausviren teilt und nicht erst kürzlich durch Rekombination erworben wurde. Die Divergenzdaten zwischen SARS-CoV-2 und dem Fledermaus-Sarbecovirus-Reservoir wurden auf 1948 (95%-Verteilung mit höchster Wahrscheinlichkeit [HPD]: 1879–1999), 1969 (95%-HPD: 1930–2000) und 1982 (95%-HPD: 1948–2009) geschätzt.

Fazit
Die Daten weisen darauf hin, dass die Linie, aus der SARS-CoV-2 stammt, bereits seit Jahrzehnten unbemerkt in Fledermäusen zirkuliert. (sh)

Autoren: Boni MF et al.
Korrespondenz: Maciej Boni; [email protected]
Studie: Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic
Quelle: Nat Microbiol 2020;5(11):1408–1417.
Web: https://doi.org/10.1038/s41564-020-0771-4