HHU-geleitetes Konsortium für Mikroskopie und Bildanalyse wird gefördert

Die NFDI ist eine Initiative zum Aufbau eines Infrastrukturrahmens für das Forschungsdatenmanagement in Deutschland. Der Hintergrund ist, verlässliche zentrale Standards und Infrastrukturen für die Speicherung, Vernetzung und Nutzung von Daten aus Wissenschaft und Forschung zu entwickeln. Damit sollen Daten über Fächer- und Einrichtungsgrenzen hinweg genutzt werden können.

Die NFDI4BIOIMAGE-Initiative fokussiert sich auf die Bereiche Mikroskopie und biologische Bildgewinnung und -verarbeitung („Bioimaging“). Gerade hier fallen riesige Mengen an Forschungsdaten an. Bereits in jedem Pixel eines Mikroskopbildes steckt eine Fülle von Informationen: räumliche, zeitliche und spektrale.

Für viele Disziplinen der Lebenswissenschaften, die auf Bioimaging angewiesen sind, ist das adäquate Datenmanagement unerlässlich, es ist aber bisher nicht hinreichend realisiert. Dies kann ein substantielles Hindernis für die Wissenschaft darstellen, die insbesondere auch auf Reproduzierbarkeit angewiesen ist.

In dem von der HHU geleiteten, methodenzentrierten Konsortium sollen Lösungen entstehen, damit Bioimaging-Daten über disziplinäre Grenzen hinweg geteilt und wiederverwendet werden können. Damit soll der volle Informationsgehalt der Daten ausgeschöpft werden. Ebenso sollen sie der Re-Analyse zur Verfügung stehen, um so – möglicherweise über die ursprüngliche Fragestellung hinaus – neue Erkenntnisse zu gewinnen.

Prof. Stefanie Weidtkamp-Peters, Sprecherin des Konsortiums und Leiterin des Center for Advanced Imaging (CAi) an der HHU: „Ein Grundbaustein unserer Strategie ist es, ein gemeinsames, Cloud-kompatibles und interoperables digitales Objekt zu definieren, als Dateneinheit aus binären Bilddaten und den zugehörigen Metadaten. Mit NFDI4BIOIMAGE wollen wir eine Infrastruktur bereitstellen, die einerseits disziplinspezifischen Anforderungen gerecht wird und die andererseits an andere Datentypen und Systeme zum Forschungsdatenmanagement anderer wissenschaftlicher Disziplinen anschließt.“

Am Konsortium sind insgesamt zehn Universitäten und Forschungseinrichtungen sowie die Fachgesellschaft „German BioImaging – Gesellschaft für Mikroskopie und Bildanalyse e.V.“ beteiligt. Das Konsortium wird von der HHU und vom Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) in Heidelberg koordiniert, hierzu wird an beiden Orten jeweils eine Koordinationsstelle angesiedelt.

Darüber hinaus wird die Stelle eines „Data Stewards“ geschaffen, um Standards für das Forschungsdatenmanagement im Bereich Mikroskopie- und Bilddaten weiter zu etablieren, die Integration von Bilddaten mit anderen Datentypen und Datenmanagementsystemen zu ermöglichen und Forschende jeder Karrierestufe im Bereich Forschungsdatenmanagement weiterzubilden. Außerdem wird an der HHU die Stelle des „Data Format Ambassador“ angesiedelt. Seine Funktion ist es, gezielt an der Umsetzung eines gemeinsamen, Cloud-kompatiblen neuen Bilddatenformates vor allem auch in den fachübergreifenden Sektionen der NFDI zu arbeiten.

Prof. Martin Mauve, Prorektor für Digitalisierung und Wissenschaftliche Infrastruktur: „Für den Bereich Forschungsdatenmanagement an der HHU ist es großartig, dass wir nun mit einem NFDI-Projekt vertreten sind, bei dem die Sprecherrolle an der HHU angesiedelt ist.“